中心贯彻落实《高等学校实验室工作规程》，执行《高等学校仪器设备管理方法》，按照专业评估和专业工程认证标准，对实验室进行科学化、规范化和制度化管理，形成网络化和开放化的实验室管理模式。实验教学中心大型仪器设备均进入“江南大学大型仪器设备共享平台”，使在全校范围内实现了资源共享，并加入了江苏省科学仪器设备共享服务平台。面对全校和社会开放，提高了仪器设备使用效率，绝大多数仪器设备的利用率都在95%以上。中心设有专职设备管理员，负责设备登记、日常维护和操作使用等工作，管理责任落实到人，固定资产账、物相符率达100%。仪器设备有使用维修记录，定期对仪器设备进行检查维护，设备完好率达98%以上。近3年学校向中心提供运行经费（实验消耗、仪器设备维护）66万元，以保证中心仪器设备的正常运行。